Bez mikrobiomu by mamut nebyl skutečným mamutem — nový výzkum ukazuje, že oživení vyhynulých druhů se neobejde bez zohlednění jejich dávných bakteriálních společníků.
Mikrobiota je v centru pozornosti vědců. Objevujeme stále více souvislostí mezi mikroorganismy, které obývají naše těla, a jejich vlivem na naše zdraví. Nerovnováha bakterií a hub, které osidlují naše střeva, může mít vliv na rozvoj neurodegenerativních onemocnění. Ačkoli se zájem o mikrobiotu soustředí především na lidské zdraví, její význam sahá daleko za tento rámec. Vezměme si další současný trend: deextinkci neboli myšlenku oživení vyhynulých druhů, kterou propagují společnosti, jako je Colossal Bioscience. Představte si, že bychom mohli naklonovat mamuta? Jakým bakteriím bychom ho vystavili, abychom znovu vytvořili vhodnou mikrobiotu?
Problém je v tom, že matka klonovaného mamuta by nebyla mamut a my jsme tisíce let vzdáleni od ekosystémů, které tato zvířata obývala. Pokud je velká část naší biologické identity spojena s naší mikrobiotou, byl by tento aseptický pachyderm skutečným mamutem? Nedávná studie publikovaná ve vědeckém časopise Cell vnesla do této otázky světlo a překonala přitom rekordy. Týmu vědců, z nichž někteří jsou spojeni se společností Colossal Biosciences, se podařilo analyzovat genetický materiál bakterií nalezených v mamutích ostatcích. Nedokážeme určit, jak moc se tyto bakterie podílely na mikrobiotě těchto zvířat za jejich života, ale víme, že koexistovaly ve stejném čase a na stejném místě.
Dobré, nebo špatné? Nejspíš ani jedno Je možné, že některé z těchto bakterií byly pro zdraví mamutů prospěšné, některé neutrální a některé škodlivé. Některé mohly dokonce přispět k jejich vyhynutí. Takže i když neplánujeme mamuty vyhubit, informace z této studie jsou pro život těchto prehistorických savců objevné. Již více než deset let analyzujeme DNA mamutů, a přestože se podařilo dosáhnout významného pokroku při čtení a rekonstrukci jejich genetických sekvencí, bakterie jsou méně prozkoumaným aspektem.
Zdroj: Youtube.com
Nejstarší ze 483 analyzovaných vzorků mamutů (440 nepublikovaných) pochází z doby před přibližně 1,1 milionu let. Jeho bakterie jsou tak nejstaršími geneticky sekvenovanými bakteriemi vůbec. Musíme však být obezřetní. Skutečnost, že můžeme analyzovat část jejich genetického obsahu, neznamená, že je možné rekonstruovat celou jejich DNA. Za milion let genetický materiál degradoval, a pokud budeme mít štěstí, můžeme přečíst malé fragmenty, které jsou však dostatečně informativní na to, abychom mohli identifikovat jeho moderní příbuzné nebo alespoň vyloučit, že patří samotnému mamutovi.
Zuby a další tkáně pod mikroskopem Studie se zaměřila na analýzu zubů a dalších měkkých tkání, které se v těchto exemplářích více či méně zachovaly. Přestože nejstarší z nich je starý více než milion let, někteří z analyzovaných mamutů jsou mnohem mladší. Tým, který tento výzkum prováděl, byl ve skutečnosti stejný jako ten, který před rokem publikoval studii, podle níž se poslední mamuti na Wrangelově ostrově (Rusko) vyskytovali teprve před 4 000 lety.
Co se týče výsledků: studie identifikovala šest hlavních kladů spojených s hostitelem a mezi jmény jsou známé rody jako Pasteurella , Streptococcus a Erysipelothrix , mikroorganismy, které jsou stále patogenní pro jejich nejbližší příbuzné, africké a asijské slony. Při bližším zkoumání se těchto šest rodů dělí na 310 mikroorganismů. Většina z nich se k mamutovi pravděpodobně dostala až po jeho smrti, což naznačuje, že za jeho života nebyly součástí jeho mikrobiomu.
Studie tedy sice nenabízí kompletní rekonstrukci ekosystémů, ale poskytuje dílčí pohled na to, kteří mikrobi a kdy s mamuty koexistovali. Tento výzkum přináší pokrok v dosud málo prozkoumané oblasti: v oblasti dávných mikrobiomů vyhynulých zvířat a v tom, co nás mohou naučit o tom, jak žila, jak onemocněla a případně jak zemřela. I když nás tato studie nepřibližuje přímo ke klonování mamuta, základní vědecké poznatky zůstávají zásadní a připomínají nám, že ne všechny objevy by měly mít okamžité využití a že některé by měly zůstat teoretické.